制药工业相对于其它产业，具有原料成分复杂、生产过程多样、产品种类繁多等特点。制药过程中产生的废水污染物含量高、可生化降解性差、水质水量变化大，是最难处理的废水种类之一。

    制药工业污染物排放标准体系由6个分标准组成，即发酵类、化学合成类、提取类、中药类、生物工程类和混装制剂类。发酵类制药废水来源于发酵、过滤、萃取结晶，提炼、精制等过程。在药品的制备过程中，由于实际生产工艺的需求，实际生产会使用大量的化学药剂作为生产原料，这些原料在后续加工中会产生大量的异味和深色度，所形成的异味和深色度即使通过污水处理技术处理，也难以彻底去除，对自然环境有着极大的危害。主要污染指标是pH、色度、BOD5、COD，SS、动植物油、氨氮和TOC含量，急性毒性，总锌含量和总氰化物含量等。成分复杂，碳氮比失调，可生化性较差，并含有大量硫酸盐、药物效价及其降解物等生化抑制物。

    如何处理制药废水，已经成为我国绿色经济发展中需要重点考虑的问题。制药废水中难降解有机物含量多，这些难降解污染物排入水体后，长时间残留在水体中，且大多具有较强的毒性和“三致”作用，并通过食物链积累、富集，最终进入人体产生毒性。由于难降解有机物具有上述特点，因此其对环境的污染是全球性的。

    为了降低制药废水对自然环境的负面影响，制药企业和相关学者不断加强制药废水处理技术的研究，针对传统废水处理技术的不足，大力研发新型处理技术，如生物膜技术、超声波技术、微波技术等。总之，只有针对性地采用废水处理技术（或技术组合），才能确保制药废水达到行业排放标准。